Istorinis Egipto laikotarpis prasidėjo trečiojo ir ketvirtojo tūkstantmečių sandūroje iki Kristaus gimimo. Senoji kultūrinė tradicija, patirdama įsibrovėlių ir vidinių sukrėtimų, tęsėsi iki krikščionybės priėmimo IV mūsų eros amžiuje. Beveik tris su puse tūkstančio metų Egipto dievų sąrašas ir funkcijos smarkiai pasikeitė. Egipto dievai įgavo savo kaimynams būdingų bruožų ir vardų – asirai, hetitai, hiksai, helenai.
Suvienijus Egiptą valdant vienam valdovui į bendrą panteoną pateko daug atskirų šalies regionų ir genčių dievų, tačiau dauguma jų buvo gerbiami tik toje aplinkoje, kurioje atsirado jų kultas. Kai kurie dievai pamažu įgavo bendrą egiptietišką reikšmę. Deivė Bastet, turinti katės galvą, be jokios abejonės, išaugo iš kačių, kaip pelių grūdų atsargų sergėtojų, garbinimo kulto. Žemės ūkis Egipte vaidino didžiulį vaidmenįvaidmenį, skirtingai nei, pavyzdžiui, Hellas, kuris išaugo daugiausia dėl prekybos ir karinių užkariavimų. Antropomorfiniai Egipto dievai dažnai buvo apdovanoti gyvūno galva, kurios garbinimo pagrindu atsirado tas ar kitas kultas. Pavyzdžiui, dievas Totas turėjo ibiso galvą, deivė Sokhmet (Sekhmet) turėjo liūto galvą, Anubis – šuns galvą.
Kylant tam tikroms šalies vietovėms, keičiantis dinastijoms arba „perkėlus“sostinę į naują vietą, keitėsi ir „pirmojo ešelono“egiptiečių dievai. Įdomus senovės Egipto religijos bruožas buvo daugybės kosmogoninių mitų (tai yra pasaulio kilmės versijų) buvimas, ir kiekvienoje vietovėje vietinė dievybė vaidino pagrindinį vaidmenį šiuo sudėtingu klausimu.
Tokie dideli egiptiečių dievai, tapę vietinio separatizmo pagrindu, be jokios abejonės, nebuvo reikalingi nė vienai šaliai. Be to, daugybė kultų reikalavo išleisti daug materialinių išteklių, kuriuos buvo galima išleisti daug daugiau naudos šalies vidaus sutvarkymui, kariuomenės išlaikymui ir pan. Ir turėdami didelius turtus bei įtaką, kunigų klanai tiesiogiai kėlė grėsmę vienintelei faraono valdžiai.
Atsižvelgiant į viską, faraonas Amenchotepas IV, pasivadinęs Echnatonu, įveda nedidelės regioninės dievybės Atono (dieviško saulės disko) kultą kaip bendrą Egipto religiją. Tačiau tradicijos inercija buvo per stipri, ir Echnatonas miršta nesulaukęs keturiasdešimties. Pagal įtikinamiausią versiją, jis buvoapsinuodijęs. Tiesa, persekiojimas nepalietė šeimos, o jo žmona (garsioji Nefertitė) liko gyva daugelį metų po vyro mirties.
Persams, o vėliau ir helenams užėmus šalį, Egipto dievai ir deivės pamažu ima prarasti savo buvusią įtaką, smunka. Jie susilieja su įsibrovėlių dievais. Pavyzdžiui, Aleksandras Didysis Egipte buvo gerbiamas kaip Dzeuso-Amono, sinkretinės Egipto helenizmo dievybės, sūnus.
Kai Egipto dievai, kurių vardai buvo vietinės ir mišrios kilmės, pradėjo užleisti vietą naujai religijai – krikščionybei, pamažu prasidėjo senovės egiptiečių rašto užmarštis. Valdant imperatoriui Konstantinui, mirė paskutinis egiptiečių religinės tradicijos nešėjas, po kurio daugelį amžių senovės Egipto dievų vardai buvo žinomi tik iš graikų ir romėnų istorikų raštų. Tačiau abu su Egipto kultūra susipažino tuomet, kai ji jau blėso, ir vargu ar kunigai į savo religijos paslaptis įvesdavo svetimšalius (dažnai agresyvius).
Arabų mokslininkai ir europiečiai ne kartą bandė iššifruoti senovės hieroglifus, tačiau nesėkmingai. Ir tik XIX amžiaus pradžioje genialus kalbininkas Francois Champollion sugebėjo rasti raktą į Egipto tekstų iššifravimą. Nuo tos akimirkos prasidėjo modernioji Senovės Egipto istorijos ir kultūros studijų era.
